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Aunque sólo el nombre de Nabokov figura en los créditos del film como autor de la adaptación de su propia novela, su guión fue modificado por Kubrick y el productor James B. Harris. El escritor manifestó admiración por el film pero se permitió publicar la versión original de su guión en 1968, para volver evidentes las diferencias entre su concepción de la película y la de Kubrick. Desde el principio estuvo claro que la protagonista debía ser una joven adolescente en lugar de una niña y en la versión final, Kubrick prefirió que las motivaciones de Humbert fuesen más románticas que patológicas, cosa que logró al suprimir un episodio previo con otra menor. Si bien no hay ninguna escena explícita en el film, Kubrick se las arregló para cerrar cada una de las escenas entre Humbert y Lolita con sugestiones de intenso erotismo. La presencia de Peter Sellers permitió al realizador practicar la improvisación de un modo que no se volvería a permitir en films posteriores. El prólogo del film, que sitúa la acción principal en flashback, fue ideado por el realizador para provocar una mayor intriga en el espectador.